J.J. Aly a montré par des arguments généraux qu'une nappe de courant se développe dans un équilibre bidimensionnel en évolution quasi-statique du fait d'un chauffage continuel du plasma, et il a calculé un exemple explicite de ce phénomène, dont plusieurs auteurs ont affirmé qu'il devait jouer un rôle important dans le déclenchement des sous-orages magnétiques de la queue de la magnétosphère terrestre. 
Il a par ailleurs poursuivi l' étude du "modèle de Parker" décrivant de manière simplifiée l'évolution quasi-statique tridimensionnelle d'un tube de flux dont les pieds sur une frontière sont soumis à des mouvements donnés. Il a obtenu en particulier le premier résultat d'unicité pour un équilibre sans force satisfaisant une contrainte topologique.